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Il Capo Dipartimento
- Servizio per i dati, le analisi e le rilevazioni informative - Servizio I
- Servizio per la valutazione delle politiche pubbliche e gli studi tematici - Servizio II
- Ufficio per la gestione finanziaria del Fondo per lo sviluppo e la coesione, per gli interventi speciali e il supporto al funzionamento - Ufficio I
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Ufficio per le politiche di coesione europee - Ufficio II
- Servizio per la definizione della politica e il coordinamento della programmazione strategica - Servizio VI
- Servizio per la sorveglianza, la verifica e l'accompagnamento dei Programmi nazionali e dei Programmi regionali (Regioni più sviluppate) - Servizio VII
- Servizio per la sorveglianza, la verifica e l'accompagnamento dei Programmi regionali (Regioni meno sviluppate e in transizione) - Servizio VIII
- Servizio per il coordinamento delle autorità di certificazione e del monitoraggio finanziario - Servizio IX
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Ufficio per le politiche di coesione nazionali - Ufficio III
- Servizio per il coordinamento della programmazione strategica dei fondi nazionali per la coesione - Servizio X
- Servizio per la programmazione, la sorveglianza e il supporto ai programmi e ai progetti delle Amministrazioni centrali - Servizio XI
- Servizio per la programmazione, la sorveglianza e il supporto ai programmi e ai progetti di rilevanza regionale - Servizio XII
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Ufficio per il rafforzamento della capacità amministrativa per le politiche di coesione – Ufficio IV
- Servizio Autorità di Gestione dei Programmi di rafforzamento della capacità amministrativa - Servizio XIII
- Servizio per la gestione dei progetti di rafforzamento della capacità amministrativa a titolarità del DPCoes- Servizio X IV
- Servizio per la promozione di progetti e programmi per la capacità amministrativa e il raccordo con la Scuola nazionale dell'amministrazione, il sistema universitario e della ricerca - Servizio XV
- Ufficio per le politiche territoriali e la cooperazione territoriale - Ufficio V